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我室姚新生课题组在 Frontiers in immunology 发表文章

发布时间 :2021-10-02  

我室姚新生课题组在Frontiers in Immunology(IF=7.589; JCR Q1--IMMUNOLOGY)发表论文:马铁菊头蝠的TR基因座注释和特征分析。

Hao Zhou, Long Ma, Longyu Liu and Xinsheng Yao. TR Locus Annotation and Characteristics of Rhinolophus ferrumequinum.Frontiers in Immunology, 30 September 2021.https://doi.org/10.3389/fimmu.2021.741408

摘要:(1)脊椎动物的T细胞抗原受体由胚系TRA/D、TRG、TRB基因座位上的V、D、J和C基因的重排形成,是机体产生特异性免疫应答中的核心。(2)现已解析的哺乳动物TR基因座包括人、鼠、狗、貂、猪、猫、兔、羊、猴(IMGT,NCBI等),蝙蝠占所有哺乳动物的20%左右(共有1400多种不同的蝙蝠),而目前蝙蝠的TR基因座是空白。(3)本课题组根据公共数据库中共享的马铁菊头蝠(Rhinolophus ferrumequinum)的基因组序列(GCA_004115265.3,NCBI),依照TR基因座的组成和国际免疫遗传学信息系统(IMGT)等制定的TR/IG注释规则,已完成马铁菊头蝠的TR和IG基因座的注释和特征分析(IG基因座另文发表)。(4)本文注释的马铁菊头蝠的TR基因座包括TRA/D、TRG和TRB,共命名了128个V基因、3个D基因、85个J基因和6个C基因;同时,我们将初步注释的马铁菊头蝠的TR基因同目前IMGT数据库中已有的哺乳动物TR基因进行了初步的对比分析,标注出马铁菊头蝠TR基因的多个独特特征。(5)蝙蝠作为多种病毒中间宿主的带毒而不染毒的机制一直没有得到解析,蝙蝠的特异性T和B应答几乎是空白,且蝙蝠种类庞大,需要多个实验室来对比、补充不同类型蝙蝠的TR、IG、MHC测序注释和开展其功能研究实验。本文在国际上首次对蝙蝠的TR基因进行注释和对比分析,为开展蝙蝠的特异性T细胞应答奠定了初步的基础。

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