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我室姚新生课题组在Frontiers in Genetics 发表文章

2021-09-27 09:33 免疫学教研室  审核人:

日前,我室姚新生课题组在Frontiers in Genetics(IF= 4.599;JCR Q2--GENETICS & HEREDITY)发表论文:人类IGHJ基因参与重排时表现为“非随机选择”,重组信号序列可能影响人类IGHJ基因的取用频率。Bin Shi, Xiaoheng Dong, Qingqing Ma, Suhong Sun, Long Ma, Jiang Yu, Xiaomei Wang, Juan Pan, Xiaoyan He, Danhua Su Xinsheng Yao. The usage of human IGHJ genes follows a particular nonrandom selection: The recombination signal sequence may affect the usage of human IGHJ genes .Frontiers in Genetics. published: 08 December 2020, doi: 10.3389/fgene.2020.524413.

文章摘要:(1)脊椎动物BCR和TCR由胚系基因V-D-J-C重排形成,经典的“免疫克隆选择学说”认为胚系V-D-J基因“随机”参与重排。(2)RAG,TDT,KU70/KU80, XRCC4等系列酶/蛋白,按“RSS-12(7-12-9)--RSS-23(9-23-7)”配对规则完成V-D-J的重组,“12/23”规则和“超越12/23”规则的起源和具体机制目前未解析。(3)人类IGHJ基因含6个功能性基因亚家族(IGHJ1,IGHJ2,IGHJ3,IGHJ4,IGHJ5,IGHJ6),通过分析多年来(课题组)所开展的人类生理条件下和不同病理条件下BCR重链框架内和框架重排的CDR3高通量测序组库数据,发现:IGHJ4均表现为超高频取用(大于40%),IGHJ6--IGHJ3--IGHJ5多数情况下按顺序表现为中频取用,而IGH2/IGHJ1均以低频率取用。(4)课题组通过分析国内外目前已发表的论文中,“BCR重链CDR3组库数据中6个IGHJ基因家族的取用频率”(包含多种病理条件下的数据),均报道IGHJ4家族表现为最高频率的取用,其他“5个家族的取用频率高低和顺序”和课题组测序到的组库数据基本一致。(5)课题组通过详细分析人类6个IGHJ基因家族的RSS组成和特性,发现如果具有最保守的RSS组成(经典的七聚体、九聚体、23bp的间隔),可能有助于IGHJ-IGHD的重组频率的提高,提出这可能是人类IGHJ4高频取用的因素(后续需要将最高取用频率IGHJ4的RSS通过转基因小鼠等实验来验证假设)。(6)本文对开展TCR和BCR组库研究者的主要建议是:在分析TCR和BCR组库V-D-J家族取用频率同“某种病理条件”相联系时,需要考虑到“V-D-J家族取用频率”的“本底”是不同的(生理条件下,V-D-J的各个亚家族并非随机参与重排及表现为一致的频率取用)。(7)本文为“V-D-J家族非随机参与重排?”的可能机制和意义提供了理论支撑的基础数据和下一步可能实行的技术路径。

文章链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33363565/

附件【The Usage of Human IGHJ Genes.pdf已下载
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